Fakultas Farmasi Unair (FF-UNAIR) didirikan pada 17 Agustus 1963, merupakan salah satu Pendidikan Farmasi Negeri dari 13 Pendidikan Farmasi PTN (Perguruan Tinggi Negeri) di Indonesia. Status akreditasi Program Pendidikan Sarjana Farmasi pada tahun 2015 dari Lembaga Akreditasi Mandiri Pendidikan Tinggi Kesehatan Indonesia (LAMP-PTKes) adalah : Peringkat A. Sementara Program Profesi Apoteker pada tahun 2012 meraih Peringkat A yang masih berlaku hingga saat ini. Selain itu Fakultas Farmasi juga menyelenggarakan pendidikan lanjut berupa Program Studi Magister Ilmu Farmasi, Magister Farmasi Klinik, Spesialis Farmasi Klinik dan Doktor Ilmu Farmasi
FF-UNAIR adalah Penerima QUE Project Bank Dunia dan Program B (keduanya merupakan program kompetitif tertinggi Dirjen Pendidikan Tinggi Depdiknas) serta diakui oleh badan standar mutu dunia dengan mendapat sertifikat ISO 9001:2008/IWA2:2007 dalam manajemen mutu pendidikan, penelitian, pengabdian masyarakat serta kerjasama eksternal. Pada akhir tahun 2011 FF-UNAIR bergabung dengan Airlangga Integrated Management System (AIMS) yang berbasis pada ISO 9001:2008/IWA 2:2007 serta pendekatan kinerja yang mengacu pada kriteria keunggulan kinerja bagi institusi Pendidikan Education Criteria for Performance ExcellenceMBNQA 2011-2012. Pada tahun 2015, program studi Pendidikan Apoteker juga sudah mendapat rekognisi internasional dengan diperlehnya sertifikasi ASEAN University Network (AUN).
Mulai tahun 2009-2012 FF-UNAIR mendapatkan program kompetitif I-MHERE (Indonesia Managing Higher Education for Relevance and Efficiency) sub komponen B2c dari dirjen DIKTI, dengan dana dari bank dunia senilai + 10 Milyar/tahun, untuk ' Development of enterpreunership university based on research and quality assurance capacity'.
Sejak tahun 2013 Program Studi Sarjana Farmasi dan Program Studi Pendidikan Apoteker berubah nama menjadi Program Pendidikan Apoteker. Perubahan nama ini mengandung makna bahwa untuk menjadi seorang Apoteker merupakan kesatuan proses pembelajaran yang dimulai dari tingkat Sarjana Farmasi dan dilanjutkan ke tingkat Profesi Apoteker.